MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008532	T	8	8	118	125	0 %	100 %	0 %	0 %	116626973
2	NC_008532	AGA	2	6	151	156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626973
3	NC_008532	ATT	2	6	177	182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626973
4	NC_008532	TCA	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626973
5	NC_008532	GAA	2	6	239	244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626973
6	NC_008532	TGA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626973
7	NC_008532	AAC	2	6	405	410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626973
8	NC_008532	AGTA	2	8	449	456	50 %	25 %	25 %	0 %	116626973
9	NC_008532	AGC	2	6	502	507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626973
10	NC_008532	TAGCTG	2	12	513	524	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116626973
11	NC_008532	TAA	2	6	607	612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626973
12	NC_008532	TTA	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626973
13	NC_008532	GTTT	2	8	676	683	0 %	75 %	25 %	0 %	116626973
14	NC_008532	TGA	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626973
15	NC_008532	ATA	3	9	831	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626973
16	NC_008532	TGAA	2	8	879	886	50 %	25 %	25 %	0 %	116626973
17	NC_008532	GGA	2	6	1352	1357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116626973
18	NC_008532	TGCT	2	8	1404	1411	0 %	50 %	25 %	25 %	116626973
19	NC_008532	ACT	2	6	1478	1483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008532	CTA	5	15	1576	1590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008532	ATA	2	6	1593	1598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008532	TAA	2	6	1600	1605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008532	TAA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626974
24	NC_008532	A	6	6	1691	1696	100 %	0 %	0 %	0 %	116626974
25	NC_008532	AGA	2	6	1802	1807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626974
26	NC_008532	ATTA	2	8	1820	1827	50 %	50 %	0 %	0 %	116626974
27	NC_008532	GTA	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626974
28	NC_008532	T	6	6	1859	1864	0 %	100 %	0 %	0 %	116626974
29	NC_008532	GTT	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626974
30	NC_008532	GAA	2	6	1908	1913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626974
31	NC_008532	AAAGG	2	10	1965	1974	60 %	0 %	40 %	0 %	116626974
32	NC_008532	AAG	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626974
33	NC_008532	GCA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626974
34	NC_008532	GTC	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626974
35	NC_008532	GTA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626974
36	NC_008532	CAG	2	6	2254	2259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626974
37	NC_008532	TCT	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626974
38	NC_008532	CAAAT	2	10	2302	2311	60 %	20 %	0 %	20 %	116626974
39	NC_008532	AC	3	6	2341	2346	50 %	0 %	0 %	50 %	116626974
40	NC_008532	ATC	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626974
41	NC_008532	TGAA	2	8	2551	2558	50 %	25 %	25 %	0 %	116626974
42	NC_008532	TGATT	2	10	2588	2597	20 %	60 %	20 %	0 %	116626974
43	NC_008532	ACTT	2	8	2613	2620	25 %	50 %	0 %	25 %	116626974
44	NC_008532	CAG	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626974
45	NC_008532	AATT	2	8	2728	2735	50 %	50 %	0 %	0 %	116626974
46	NC_008532	T	6	6	2785	2790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008532	AG	3	6	2834	2839	50 %	0 %	50 %	0 %	116626975
48	NC_008532	TATG	2	8	2860	2867	25 %	50 %	25 %	0 %	116626975
49	NC_008532	TGA	2	6	2875	2880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
50	NC_008532	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
51	NC_008532	TTA	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626975
52	NC_008532	CT	3	6	3100	3105	0 %	50 %	0 %	50 %	116626975
53	NC_008532	AAAAGC	2	12	3120	3131	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116626975
54	NC_008532	TAG	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
55	NC_008532	TCT	2	6	3178	3183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626975
56	NC_008532	AAC	2	6	3185	3190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626975
57	NC_008532	GA	3	6	3239	3244	50 %	0 %	50 %	0 %	116626975
58	NC_008532	CTT	2	6	3308	3313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626975
59	NC_008532	GAT	2	6	3371	3376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
60	NC_008532	AGT	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
61	NC_008532	TAG	2	6	3514	3519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
62	NC_008532	GGC	2	6	3523	3528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116626975
63	NC_008532	CAG	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626975
64	NC_008532	TCT	2	6	3704	3709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626975
65	NC_008532	ACG	2	6	3845	3850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626975
66	NC_008532	T	6	6	3851	3856	0 %	100 %	0 %	0 %	116626975
67	NC_008532	GTA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
68	NC_008532	ATC	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626975
69	NC_008532	ATG	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
70	NC_008532	TTC	2	6	4085	4090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008532	AGT	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008532	T	6	6	4204	4209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008532	AGG	2	6	4214	4219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008532	GAA	2	6	4255	4260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626976
75	NC_008532	A	7	7	4291	4297	100 %	0 %	0 %	0 %	116626976
76	NC_008532	ATG	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626976
77	NC_008532	GTC	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626976
78	NC_008532	AAG	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626976
79	NC_008532	CTA	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008532	AAAT	3	12	4620	4631	75 %	25 %	0 %	0 %	116626977
81	NC_008532	CAG	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626977
82	NC_008532	GCT	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626977
83	NC_008532	CAA	2	6	4733	4738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626977
84	NC_008532	TCGT	2	8	4937	4944	0 %	50 %	25 %	25 %	116626977
85	NC_008532	GAT	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626977
86	NC_008532	AAAGAT	2	12	5104	5115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116626977
87	NC_008532	TTC	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626977
88	NC_008532	AGA	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626977
89	NC_008532	GAA	2	6	5200	5205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626977
90	NC_008532	A	6	6	5207	5212	100 %	0 %	0 %	0 %	116626977
91	NC_008532	ACA	2	6	5236	5241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626977
92	NC_008532	TGA	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626977
93	NC_008532	TGA	2	6	5292	5297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626977
94	NC_008532	AGT	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626977
95	NC_008532	GAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626977
96	NC_008532	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626977
97	NC_008532	GCA	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626977
98	NC_008532	AGC	2	6	5562	5567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626977
99	NC_008532	AAG	2	6	5663	5668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626977
100	NC_008532	GAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626977
101	NC_008532	TGT	2	6	5700	5705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626977
102	NC_008532	CAT	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626977
103	NC_008532	A	6	6	5751	5756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008532	AAT	2	6	5814	5819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626978
105	NC_008532	TAG	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626978
106	NC_008532	CAA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626978
107	NC_008532	ATCT	2	8	6020	6027	25 %	50 %	0 %	25 %	116626978
108	NC_008532	TTA	2	6	6054	6059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626978
109	NC_008532	GGA	2	6	6072	6077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116626978
110	NC_008532	GAT	2	6	6094	6099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626978
111	NC_008532	CAG	2	6	6143	6148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626978
112	NC_008532	TACT	2	8	6299	6306	25 %	50 %	0 %	25 %	116626978
113	NC_008532	ACT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626978
114	NC_008532	GAA	2	6	6409	6414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626979
115	NC_008532	TCA	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626979
116	NC_008532	TAG	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
117	NC_008532	T	7	7	6622	6628	0 %	100 %	0 %	0 %	116626979
118	NC_008532	GAT	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
119	NC_008532	GCT	2	6	6644	6649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626979
120	NC_008532	A	6	6	6672	6677	100 %	0 %	0 %	0 %	116626979
121	NC_008532	GGAA	2	8	6816	6823	50 %	0 %	50 %	0 %	116626979
122	NC_008532	G	6	6	6912	6917	0 %	0 %	100 %	0 %	116626979
123	NC_008532	T	6	6	6968	6973	0 %	100 %	0 %	0 %	116626979
124	NC_008532	GAGAT	2	10	6975	6984	40 %	20 %	40 %	0 %	116626979
125	NC_008532	TGT	2	6	7042	7047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626979
126	NC_008532	CGG	2	6	7056	7061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116626979
127	NC_008532	AGA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626979
128	NC_008532	TC	3	6	7217	7222	0 %	50 %	0 %	50 %	116626979
129	NC_008532	TGA	2	6	7282	7287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
130	NC_008532	TCA	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626979
131	NC_008532	ACT	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626979
132	NC_008532	CAGC	2	8	7424	7431	25 %	0 %	25 %	50 %	116626979
133	NC_008532	CTT	2	6	7435	7440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626979
134	NC_008532	CA	3	6	7495	7500	50 %	0 %	0 %	50 %	116626979
135	NC_008532	TCG	2	6	7552	7557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626979
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250	NC_008532	ATT	2	6	13292	13297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626984
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268	NC_008532	ATG	2	6	13905	13910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626985
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